Pada hari Rabu, 18 Juni 2025, Workshop on Statistical Machine Learning Methods for Genomic Prediction Using R Program hari kedua dimulai pukul 10.00-13.00 WIB di Ruang Ballroom FMIPA UNY. Pada workshop ini, Professor Osval Antonio Montesinos López, Ph.D. dari Universidad de Colima, Meksiko menyampaikan materi lanjutan yang mencakup tiga materi utama. Pertama, materi computational of genetic yang membahas penanda genetik dari data genotipe, proses recode informasi penanda sesuai dengan aturan, hingga perhitungan Minor Allele Frequency (MAF). Kedua, dibahas metode sistematis dalam menghitung genomic relationship matrix, yang penting untuk memahami keterkaitan genetik antar individu. Ketiga, disampaikan materi berbagai metode analisis regresi seperti ridge regression, lasso regression, dan logistic penalized regression. Materi ini disampaikan mulai dari definisi dan konsep dasar, model statistik yang digunakan, hingga penerapannya dalam kehidupan nyata, baik melalui perhitungan manual maupun dengan bantuan software RStudio.